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產(chǎn)品中心
Product Center

一步法DNA和RNA純化試劑盒

一步法DNARNA純化試劑盒

貨號

產(chǎn)品名稱(chēng)

產(chǎn)品規格


AH101

BcMag ? 一步DNA-RNA純化試劑盒

1ml


AH102

BcMag ? 一步DNA-RNA純化試劑盒

5ml


裝運條件:常溫運輸

使用一步法DNARNA純化試劑盒可實(shí)現高質(zhì)量的DNA/RNA純化。去除引物二聚體和游離核苷酸等雜質(zhì)。

簡(jiǎn)介

BcMag ? 一步法DNARNA純化試劑盒,可通過(guò)負相純化技術(shù)從純化的DNA/RNA樣品中一步操作去除雜質(zhì)。雜質(zhì)包括DNA/RNA聚合酶、修飾酶、限制性?xún)惹忻?、連接酶、磷酸激酶、核酸酶、磷酸酶、蛋白質(zhì)、大多數洗滌劑、大多數熒光或熒光染料、二價(jià)陽(yáng)離子如Ca2+、Mg2+、過(guò)量引物、二聚體、銜接子、DNA/RNA片段(<100-mer ssDNA)、游離dNTPs/NTPs及其類(lèi)似物,包括放射性標記的,生物素化和熒光衍生物。


該方案操作簡(jiǎn)單:僅需一管,一步,一分鐘(圖1)。將磁珠直接添加到純化的DNA/RNA樣品中,通過(guò)渦旋或移液以捕獲和去除雜質(zhì)。渦旋/移液后,磁珠被磁力架捕獲,而上清液中含有純化的,可進(jìn)行下有反應的樣品。磁珠適用于DNA/RNA片段,質(zhì)粒DNA和基因組DNA。

特點(diǎn)及優(yōu)勢

l 簡(jiǎn)單的過(guò)程:不用移液,一步,一管

l 超快純化過(guò)程:一分鐘可以完成純化

超高的純度和回收率:回收率> 90%

高效的清除效率:可以清除過(guò)量的引物 (<100 mers ssDNA),二聚體,接頭分子,鹽

Mg2+,洗滌劑,dNTPS,各種酶,以及熒光物質(zhì)。

l 無(wú)需純化柱,以及過(guò)濾器,不用費力的反復移液吹吸,也不使用酒精。

l 高通量:可兼容多種不同的自動(dòng)化液體處理系統

 

操作流程

A.用戶(hù)所需材料

l 18.2 MΩ.cm, 無(wú)DNase/Rnase的超純水

l Triton? X-100, Sigma, Catalog # T8787

其他

Item

Source

力分離器

**根據樣品體積,用戶(hù)可以選擇以下磁力分離器之一

BcMag? separator-2 適用于兩個(gè)單獨的1.5毫升離心管 (Bioclone, Cat.# MS-01);

 BcMag? separator-6 適用于六個(gè)單獨的1.5毫升離心管 (Bioclone, Cat.# MS-02);

 BcMag? separator-24 適用于24個(gè)單獨的1.5-2.0 ml離心管 (Bioclone, Cat.# MS-03);

 BcMag? separator-50 適用于1個(gè)單獨的50毫升離心管,1個(gè)單獨的15毫升離心管, 以及4個(gè) 1.5毫升 離心管 (Bioclone,Cat.# MS-04

 

BcMag 96磁力分離器

BcMag 96-well Plate Magnetic Separator (side-pull,) 或者 96-well PCR plate  96-well microplate, 或其他兼容的磁力分離器(Blioclone,  Cat#: MS-06)

可調單通道和多通道移液器

 

擺斗離心機

 

如果使用96PCR/管,則需要添加項目

渦懸混合器

**用戶(hù)還可以使用其他型號的渦懸混合器。但是,時(shí)間和速度應進(jìn)行優(yōu)化,并且混合器應滿(mǎn)足:  扭矩  ≥1.5 mm-4 mm, 轉速 ≥ 2000 rpm

Eppendorf? MixMate?

Eppendorf, Cat#:5353000529

Tube Holder PCR 96

Eppendorf, Cat#: 022674005

Tube Holder 1.5/2.0 mL, for 24?×?1.5 mL or 2.0 mL

Eppendorf, Cat#: 022674048

Smart Mixer, Multi Shaker

BenchTop Lab Systems, Cat#:5353000529

 1.5/2.0 mL 離心管

96PCR或者 8 PCR

PCR /

 **重要提示! 如果使用其他管或PCR板,確保PCR管或PCR板錐形部分底部的井徑必須≥2.5毫米。

B.實(shí)驗步驟

重要提示!

以下過(guò)程是經(jīng)過(guò)優(yōu)化的用于高效純化10μl DNA樣品。如果應用于其他體積的反應條件,

則需要對操作步驟進(jìn)行優(yōu)化。

l 磁珠使用前,請先將磁珠徹底渦旋或震蕩懸浮,確保磁珠處于混勻狀態(tài)

不允許磁珠在靜置2分鐘后再進(jìn)行產(chǎn)品的使用

根據應用,用戶(hù)應根據表1選擇緩沖條件。例如,如果樣品不含去垢劑,則需要添加

1μL 1%Triton? X-10010μL樣品(最終濃度為0.1%。

核酸定量:僅使用熒光方法檢測,如qPCR、QubitPico Green。

表一

DNA 片段清除

 

+ 0.1%

Triton x-100, pH7.5

- 0.1%

Triton x-100

pH7.5

+ 0.1%

 Triton x-100

pH 8.0

- 0.1% Triton x-100

pH 8.0

+ 0.1%

 Triton x-100

pH 8.8

- 0.1%

Triton x-100

pH 8.8

dsDNA

(100 bp)

未清除

清除

清除

清除

未清除

清除

dsDNA

(150 bp)

未清除

清除

未清除

清除

未清除

清除

dsDNA

(200 bp)

未清除

清除

未清除

清除

未清除

清除

dsDNA

(300 bp)

未清除

未清除

未清除

未清除

未清除

未清除

ssDNA

100 mer

清除

清除

清除

清除

清除

清除

dsDNA- 雙鏈 DNA;    ssDNA- 單鏈 DNA

述驗證時(shí)通過(guò)下列條件完成的:

1. 10 mM Tris-HCl 含有或者不含有 0.1% triton (最終含量) 以及以下三個(gè)變量:  pH 7.5, pH 8.0  pH 8.8

1. 添加5ul磁珠產(chǎn)品到10ulDNA待純化樣品中。

2. 如果需要,可短暫的2500rpm離心30秒,使所有成分都處于試管底部

3. 徹底混勻1分鐘,通過(guò)緩慢的使用移液器吹吸25(一分鐘時(shí)間);或者2500 rpm

渦旋震蕩5分鐘。

4. 如果需要,可短暫的2500rpm離心30秒,使所有成分都處于試管底部

5. 將裝有樣品的試管放入磁力分離器中30秒,直到磁珠徹底被吸附到試管底部,上清

液變澄清為止。

6. 將試管保持在磁力分離器中,同時(shí),將上清液轉移到一個(gè)干凈的試管當中,用于下 

游實(shí)驗。

C.故障排除

DNA回收率低

渦旋時(shí)間太長(cháng)

或者渦旋速度太快

· 減少渦旋時(shí)間或者速度

· 如果使用其他型號的渦旋混勻器,則渦旋時(shí)間和速度需要重新優(yōu)化 

磁珠使用過(guò)多 

   徹底的懸浮磁珠,并準確的加入磁珠的用量

樣品緩沖液未優(yōu)化

· 如果樣品中不含有去垢劑,向樣品中添加曲通拉X-100(最終濃度為0.1%

雜質(zhì)去除失敗

PCR 管或者PCR 板型號不對

確保PCR 管或者PCR 板的底部圓錐形截面直徑≥2.5mm.

渦旋的速度太慢或者渦旋時(shí)間太短

· 增加渦旋的速度或者渦旋時(shí)間

· 如果使用其他型號的渦旋混勻器,則渦旋時(shí)間和速度需要重新優(yōu)化.

磁珠使用量太少

徹底的懸浮磁珠,并準確的加入磁珠的用量

 DNA片段有強的二級結構 (<50bp dsDNA or < 100 mer ssDNA)

通過(guò)95°C加熱2分鐘使樣品變性

有太多的引物,二聚體,銜接體,游離染料或者去垢劑

· 增加磁珠使用量

· 進(jìn)行第二次純化,按照相同的純化過(guò)程